供贮用的洋葱以选择黄皮、扁圆形、水分含量低、辛辣味浓、鳞茎颈部细的为宜。贮藏用洋葱以最下方的1-2片叶干枯、地上部开始倒伏时收获为宜。收获后进行晾晒，将洋葱斜向排列，使每一排茎叶正好盖在前一排的葱头上，以免葱头受阳光直接曝晒，2-3天翻1次，一直晒至叶子发黄，需4-6天。然后将葱叶编成长约1米的"辫子",两条"辫子"结在一起成为一挂，每挂约60个葱头。编好"辫子"的洋葱还需晾晒5-6天，晒至葱头充分干燥，颈部完全变成皮质时为宜。在洋葱晒"辫子"期间，如受雨淋，洋葱就很难再晒干，而且容易腐烂，所以晾晒期间应注意避雨。
处理好的洋葱应随即入贮，通常将它挂在屋檐下或室内。挂藏室要求通风良好，并保持干燥。也可用堆藏法，即在地势高、排水好的地方，以稻草或麦秆垫底，再垫两层苇席，然后将葱头一挂一挂堆高至1.50米，顶部盖3-4层苇席，四周用苇席围起；再用绳子横竖扎紧，避免阳光直晒或雨水渗入。也可除去葱叶平铺在菜架上贮藏。
注意在贮藏前期洋葱易腐烂，所以前期要保持干燥；贮藏后期洋葱易抽芽，可在采收前2-3周，用0.25%新鲜素溶液喷洒洋葱，能抑制抽芽，也可在洋葱收获后用0.25%的新鲜素沾根。
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