冬暖棚因建造时费工、费时、投入高，建成后一般使用多年，冬暖棚均在人为的环境下种植高产、高效经济作物，连年大量施肥、喷施农药等因素，造成棚内土壤污染严重，很多冬暖棚内出现了肥料的大量施用，但增产效果不明显，甚至减产的现象。因此，合理的培肥技术是冬暖棚增加收益的有效措施之一。
一、增施有机肥，培育肥力。增施有机肥料，既能营养植物，又能改善土壤的物理性质，提高土壤肥力。提倡腐熟的有机肥（如鸡粪、猪粪等）同非腐解态作物秸秆（如玉米秸秆、小麦秸秆）混合使用。据中国科学院南京土壤研究所试验表明：非腐解有机物对增加土壤腐殖质中活性腐殖质显然比堆腐有机物有较大作用。此外，非腐解态有机物，对增加土壤的生物活性，比腐解的有机物也有较好的作用，但施用量不可过大，也不可过晚，一般每亩施用量为1000公斤左右。
二、合理安排茬口，以地养地。同一棚内，根据经济作物的特性，合理地安排茬口，实行种养结合。常见有以下几种类型：⑴冬春菜夏秋粮。冬春种植蔬菜，夏秋两季种植粮食作物，采取粮菜间作，避免了蔬菜根结线虫病的发生及危害，同时防止蔬菜作物根部病害的枯萎病、根腐病等的发生及危害。⑵冬春菜，夏秋养。冬春种植蔬菜，夏秋采取覆盖遮阳网或草苫的方法，在棚内发展养殖。如山东邹城北宿镇东故村菜农孙雨河，冬春种菜，夏秋养鸡鸭等，不仅效益成倍增加，而且培肥了棚内土壤地力。⑶冬春菜，夏秋肥。冬春种植蔬菜，夏秋种植绿肥作物，秋季深翻土壤中，力求2-3年能轮种一茬绿肥作物。
三、合理的深伏耕。深耕的作用，加厚了耕作层，改善了土壤结构和耕性，降低了土壤容重，使土、肥、水相容，促进了土壤微生物的活动，加速了土壤熟化。冬暖棚深耕时间一般安排在夏季，冬春菜收获后及时深耕，争取有较长的晒垡及风化时间，以促进土壤熟化及养分的释放。深耕应逐年加深，不打乱土层。
四、混合肥料作基肥。蔬菜在生长发育过程中，需要的养分较多也较全面，基肥施用上最好采用多种肥料混合使用，如迟效与速效不同肥料的混合，可速效氮与有机肥混合，这样可以取长补短，使肥效平稳持久。
五、合理的追肥。根据蔬菜作物生长发育过程中的外部表现，合理地追施速效肥料如化肥、腐熟的优质有机肥料等。一般在蔬菜作物结果期需肥量增加，除追施适量的氮肥外，还应加大磷、钾及微量元素的使用，因蔬菜作物此时已封垄，追肥难以做到深施，如冬春黄瓜常采用在灌溉时在地头入水口处撒施，并不断搅拌。使肥料随水进入田间并渗入土壤。
六、改变灌溉方式。有目的地提倡、逐步完善滴灌技术。试验表明，冬暖棚采用滴灌，延缓了土壤板结，节约用水，防止次生盐渍化、次生潜育化，同时防止因大水漫灌，增加棚内湿度，病害发生危害严重等现象的发生。
七、喷施"免深耕"土壤调理剂。免深耕土壤调理剂内含高活性物质，以水为媒介能有效打破长期施用化肥等管理粗放造成的土壤板硬，增加土壤团粒结构，保水节肥，减轻土传病害，促进根系生长。每亩200克兑水100公斤喷洒在蔬菜作物行间（避开植株，土壤要湿润），20天后观察20-100厘米深的土壤疏松通透，蓄水保肥力增强，抗旱排涝，土壤微生物增多，作物根系发达，而且下扎深度加深。
八、叶面追肥。在蔬菜作物生长后期，根系吸收养分能力减弱，叶面追肥就能及时补充根系吸收养分的不足。除追施氮、磷、钾等大量元素外，还应追施钙、硼、镁、铁等微量元素及腐殖酸。
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